„Tajne wejście: Watykan” pokazuje od środka, jak funkcjonuje Stolica Apostolska, poczynając od tajnych archiwów, a kończąc na Gwardii Szwajcarskiej. Przy okazji poznamy również niektóre z tamtejszych skarbów i tajemnic. Zobaczmy więc, co się znajduje na tych 44 hektarach dawnego cmentarza, na którym zbudowano Watykan i gdzie podczas prac wykopaliskowych odkryto wiele bezcennych znalezisk, takich jak kości samego św. Piotra. W tajnych watykańskich archiwach przyjrzymy się kolekcji bezcennych dokumentów. Poznamy też tych, którzy chronią Stolicę Apostolską: szwajcarskich gwardzistów (elitarną formację strzegącą papieża), watykańską policję oraz wydział włoskiej policji zajmującej się bezpieczeństwem papieża i Watykanu.